刘秉章带人去戏院抓共产党，抓了平川，并且说方云天是在场和共产党接头，要枪杀他们。危急时刻，高文轩赶来为他解围，放走了他们。高文轩和刘秉章两人就方云天是不是共产党而争论不休，云子也认为怀疑方云天是匪夷所思。雄一怀疑有内鬼，行动才会失败，让文轩负责查处内鬼。
雄一怀疑放药品的地方已经暴露，文轩询问需不需要转移，雄一认为共产党只敢在背后嘀咕小打小闹，不必转移。云天无意发现客厅有窃听器，为了迷惑敌人，云天故意把音乐声音放到最大，并与如画在客厅跳舞，他们决定将计就计地演一场戏，麻痹敌人。云子听到他们的调情对话后非常生气。云子吩咐手下要二十四小时监控，一刻也不能离开。
云天在电话中用摩斯密码得到情报，他和如画顺利地甩掉了监视者。吉田君侮辱高文轩是靠女人吃软饭的东西。高文轩调查内鬼事件，约谈吉田，怀疑他酒后口无遮拦，大意泄露情报。吉田愤怒，攻击文轩却反被文轩所制。
刘秉章在夜里偷偷地运送抗菌药，和义子在车旁分析川岛让高文轩调查内鬼一事的原因。吉田不甘心的深夜伏击高文轩，被抓到川岛面前对峙。吉田要求与高文轩决斗，雄一和云子都没有答应，高文轩却欣然同意。两人在众人的见证下在花园决斗，吉田偷袭失败意外被文轩杀死。
秦叔跟踪各个公司的运输车队，怀疑抗菌药被全放在了鹭岛。鹭岛地势险峻，三面环山，一面环水。只有一条路进出。方云天又收到神秘人传来的情报。高文轩派人砸了郑老板的码头，让张龙收编码头，换上自己的人。
血色樱花第29集剧情介绍高文轩拿起机枪就对着紧闭的大门扫射，他狠辣的手段成功地解除了川岛雄一对他的怀疑。秦叔调查发现鹭岛驻守了大批日军，只有一条路进，目前能够进去的只有物资和劳工。方云天计划利用拉劳工的机会混进去。小泽询问方家老宅转给日本商会的交易什么时候进行，方云天借故又拖了五天。
川岛雄一让文轩接受了高桥的工作以及手下，并安排他去围剿霞飞路上的一个共党情报站。云子听着监控里云天和如画打情骂俏，怒火中烧，派人要把如画干掉。如画正与博然在面摊吃面，一个英国人坐下向如画搭讪，有人报信让如画快走，如画没有理会。蒙面人杀了一个伏击者，如画在博然的掩护下安全逃走，云子生气胡乱开枪不小心杀了那个英国人。
秦叔调查日本人的招工地点，希望从中安插自己人进去。黄局长带人去黑龙会调查英国人被杀事件，文轩帮云子掩饰，川岛雄一得知情况始末后怒斥云子，称要送云子回国。
川岛雄一派人烧了云天的药厂和药品。商会会员纷纷指责云天和日本商会作对，影响了大家的利益，云天辞去上海商会会长一职。川岛雄一带人准备于晚上在情报站抓捕来接头的共产党。文轩暗中通过卖烟人通知云天不要去情报站。云天疑惑中赶到情报站，杀了两个日本人示警，钟先生等人顺利逃走。文轩和云子分开继续追捕，文轩有意放走云天。谁知云天还是被云子抓住，坦白了自己共产党的身份。
血色樱花第30集剧情介绍（大结局）云子拿枪指着云天，怀疑他的身份。云天大方承认自己是共产党员，让云子开枪。云子说自己恨他，恨他变心。云天告诉她，两人已经身不由己，当时自己是在演戏，没想到却伤了云子的心。云子哭着放下枪，告诉他自己不后悔爱过他。
云子告诉川岛，自己决定从心底放弃云天，她决定回日本。文轩疑惑云子的改变，云子告诉他自己不喜欢在中国的自己，她不喜欢仇恨、报复。文轩表示自己也是如此，两人相拥和解。
文轩引出云天见面，云天终于知道一直给他传递情报的是文轩。文轩告诉他，川岛明天送云子离开后，将会去鹭岛，抗菌药就在那里。文轩还提醒云天，川岛会烧掉云天的别墅，让他赶紧离开。
第二天出发前，云天藏在文轩车的后备箱里，平川扮成文轩随从。众人一同送走云子后，来到了鹭岛。秦叔带领众弟兄也潜进了鹭岛。平川准备放云天出来时被人察觉，双方九次开打。此时，云子折回驱车赶往鹭岛。
云天和文轩并肩作战，刘秉章死在文轩枪下。如画和钟先生在船上指挥药品搬运，平川在掩护博然时中弹身亡，如画强忍悲痛，开船护送药品离开。
云天和文轩决定炸弹日本人的军火库，两人赶到军火库时文轩川岛打中，云天愤怒地冲出来没想到手枪已没了子弹。川岛准备向他开枪时，云子出现为云天挡下了子弹，微笑着死去。川岛发狂扑向云天，两人打斗中，军火库爆炸。
一切结束后，平安无事的云天和如画终于幸福相拥。
